O Colegiado, órgão deliberativo e consultivo, exerce a coordenação pedagógica e administrativa do curso de Ciência da Computação e é constituído por docentes do curso, por representantes discentes (conforme previsto no Regimento Geral da Universidade Federal do Tocantins, Art. 35, Cap. I, Seção I) e por representante(s) dos técnicos administrativos do curso. Atualmente o Representante técnico Administrativo é Caio Cesar Bonfim ( Secretário do Curso) e a Representação discente esta em vacância.